Manuel Belgrano murió el día 20 de junio de 1820 a las 7:00 a.m., en Buenos Aires, Argentina, sumido en una inmensa pobreza. Se encontraba en su casa paterna (actualmente en la Av. Belgrano nº 430). Belgrano falleció el mismo día en que se produjo la caída del directorio y el nacimiento de Buenos Aires como provincia federal.
En ese momento presentaba una hidropesía severa. Desde su lecho de muerte fue trasladado hacia el Convento de Santo Domingo donde fue sepultado en un atrio.
Sus restos fueron exhumados el 4 de septiembre de 1902, por petición del por entonces presidente Julio Argentino Roca. Los restos fueron depositados en una urna ubicada en el monumento erigido en el mismo atrio del Convento de Santo Domingo.
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